初创项目组和企业创新组各自独立评选、独立设奖。采用6+12模式评选，即每个参赛项目展示6分钟，选手与评委互动12分钟。评委根据选手表现现场打分，由低至高选出10名选手。打分标准依照首届中国（深圳）创新创业大赛决赛评分标准。
深圳市南山区科技创业服务中心、深圳硅谷大学城创业园、中国科技开发院、深港产学研基地、深圳市高新区生物孵化器管理公司、深圳市佳利泰嵌入式软件孵化器公司、深圳市百盈医疗器械孵化器管理公司、深圳集成电路设计产业化基地管理中心、深圳清华大学研究院、深圳虚拟大学园管理服务中心、深圳北科招商创业园管理有限公司、深圳市留学生创业园有限公司、深圳软件园管理中心、深圳市医疗器械行业协会